По идее так и должно работать,
то есть

Чеки после 12 часов ночи переводятся на день назад,
Расходная накладная создается датой на день назад
а фин. документ создается датой и временем последнего пробитого чека
то есть если чек был последний после 12 часов ночи то фин. документ будет создан следующим числом
а чеки и расходные накладные прошлым

Если поставить обновление версии TS 5.3.37.221
там рядом с настройкой - "Закрытие смены одним числом есть еще одна галочка
которую нужно поставить чтобы фин. документ создавался тоже как и чеки на день назад.

Но там есть нюансы.
Вы этом случае важно не создавать фин. документов смены после 12ч ночи.

-Для любознательных, которые хотят понимать как это работает-

Механизм расчета сумм при закрытии смены такой:

Например :
Последний фин. документ по закрытию смены был 01.02.11 23:50

(возможно внесение денег на размен было выдано 01.02.11 07:55)

Реализация чеков была с  01.02.11 08:10 по 02.02.11 02:15
последний чек за 01.02.11 был пробит в 23:48

(возможно выдача денег из кассы была 01.02.11 22:11)

Так вот...

Для подсчета сколько денег должно быть в кассе
Собираются все чеки не прошедшие закрытие смены - в нашем случае - с  01.02.11 08:10 по 02.02.11 02:15 выручка например =1000 грн.

находится последний фин. док по закрытию смены - 01.02.11 23:50
и за этот период по текущее время выбираются все фин операции смены,
то есть получение денег как разменка и выдачи денег из кассы
например получали 01.02.11 07:55 = 50грн  забирали 01.02.11 22:11 = 200грн.

Тогда Выручка в кассе 1000 грн+ 50 грн -200 грн=850 грн должно быть в кассе
именно эти деньги и будут требоваться при закрытии смены

При закрытии все чеки после 12 меняются датой на 1 день назад то есть все чеки 01.02.11 23:50 по 02.02.11 02:15
поучат дату 01.02.11 а время пробития так и останется ночное.
Расходные накладные создадутся 01.02.11
И фин. документ - ПРИ УСТАНОВЛЕННОЙ НОВОЙ ГАЛОЧКЕ
создастся датой и временем последнего пробитого чека до 12 ночи то есть в 23:48

При закрытии смены одним числом-
Если мы сделаем выдачу денег после 12 ночи
то это повлияет на правильность рассчета денег в кассе на следующее закрытие смены,
так как для расчета денег в кассе будут обрабатываться все документы начиная даты и времени фин.документа  последнего закрытия смены
а в нашем случае он будет создан временем последнего пробитого чека до 12 ночи то есть в 23:48

и если будет фин документ после 12 ночи то на следующем закрытии смены он попадет в период
рассчета выручки в кассе и фактически его делали вчера а повлияет он на закрытие смены сегодня.