>1. В группе продуктов снимаю галочку не показывать в окне кассира, а группы все равно показываются, как убрать, чтоб не
>показывались не нужные группы.

   Там , всплывающая подсказка - не для версии с TouchScreen...

  Для точ скрина чтобы группа не отображалась нужно
  запретить все калькуляции принадлежащие этой группе
  а так же продукты на всех складах кроме "основного".
  (заходим на склад, находим продукт - внизу кнопка "Запрет" - синим цветом строка- запрещена - черным - разрешена)
  продукт первый раз попавший на склад сразу становится доступным к продаже.

  На точ скрине кнопки разрешенных продуктов формируются при запуске программы,
похтому если кассовое место на точ скрине запущено, нужно перегрузить программу.

>2. Как изменить розничную цену калькуляции.

      Либо переоценкой продуктов , которые в нее входят,
      дибо в самой калькуляции менять закладки продуктов ,
      а так же скидкой/наценкой.
      Рекомендуется делать переоценки в начале рабочего дня,
      так как если  делать это  в середине дня, сумма чеков за этот
      день не сойдется с суммой расходной накладной, формирующейся
     при закрытии смены и подхватывающей последее состояние калькуляций и цен продуктов.

>3. Раздел операции - Финансовые операции все суммы в минусах, почему?

    Расходные накладные со знаком "минус"
    Приходные накладные без него.